Para buscar los ficheros que han sido eliminados en un determinado repositorio podemos utiliza el siguiente commando
git log --diff-filter=D --summary | grep delete
Si lo que queremos es tener información más concreta sobre el commit, el usuario y la fecha del borrado, podemos utilizar quitar el grep.
git log --diff-filter=D --summary
Si queremos buscar el nombre concreto de un fichero eliminado podremos complementarlo con el comando grep.
git log --diff-filter=D --summary | grep "nombre del fichero"